Karya-karya KH. Bisri Musthofa jika diklasifikasikan berdasarkan bidang keilmuan dibagai kedalam beberapa fan berikut.
Bidang Tafsir
Selain tafsir Al Ibriz, KH. Bisri Musthofa juga menyusun kitab Tafsir Surat Yasin. Tafsir ini bersifat sangat singkat dapat digunakan para santri serta dai di pedesaan. Termasuk karya beliau dalam bidang tafsir ini adalah al-iksier yang berarti “ Pengantar Ilmu Tafsir” ditulis sengaja untuk para santri yg sedang mempelajari ilmu tafsir.Hadist
Beberapa kitab hadis yg beliau susun diantaranya :• Sullamul Afham, terdiri dari 4 jilid, berupa terjemah dan penjelasan. Didalamnya memuat hadist2 hukum syara’ secara lengkap dengan keterangan yg sederhana
• Al Azwad al Musthofawiyah, berisi tafsiran Hadist Arba’in Nawawi untuk para santri pada tingkatan Tsanawiyah
• Al – Mandhomatul Baiquny, berisi ilmu Musthalah al Hadist yang berbentuk nadham
Aqidah
• Rawihatul Aqwam• Durarul Bayan
Syari’ah
• Sullamul Afham li Ma’rifati Al Adillatil Ahkam fi Bulughil Maram• Qawa’id Bahiyah, Tuntunan Shalat dan Manasik Haji
• Islam dan Shalat
Ahlak / Tasawuf
• Washaya al-Abaa’ lil Abna• Syi’ir Ngudi Susilo
• Mitra Sejati
• Qashidah al-Ta’liqatul Mufidah (Syarah Qashidah al Munfarijah karya Syeikh Yusuf al Tauziri dari Tunisia)
Ilmu Bahasa Arab
• Jurumiyah• Nadham ‘Imrithi
• Alfiah Ibn Malik
• Nadham al Maqhsud
• Syarah Jauhad Maknun
Ilmu Mantiq / Logika
• Tarjamah Sullamul Munawarraq, memuat dasar2 berpikir yg sekarang dikenal dengan ilmu Mantiq dan logika.Sejarah
• An-Nibrasy• Tarikhul Anbiya
• Tarikhul Awliya
Bidang lain, diantaranya
• Buku tuntunan para modin berjudul Imamuddin
• Tiryaqul Aghyar terjemah Qashidah Burdaul Mukhtar
• Kitab kumpulan do’a berjudul Al Haqibah